由于總面積是一定的，而許多第三方物流企業(yè)在建造自動化立體倉庫時只重視辦公、實驗(包括研發(fā))的面積，卻忽視了庫房面積，因此造成了這種局面，即為了滿足庫容量的需要，只好通過向空間發(fā)展來達到要求。但是貨架越高，機械設備的采購成本和運行成本也就越高。除此之外，由于自動化立體倉庫內(nèi)優(yōu)的物流路線是直線形的，但在倉庫設計時往往會受到平面面積的限制，造成本身物流路線的迂回(往往是s形，甚至是網(wǎng)狀)，這會增加許多不必要的投入和麻煩。

自動化立體倉庫的上游、下游及其內(nèi)部各子系統(tǒng)的協(xié)調(diào)，有一個木桶效應的問題，即短的那一塊木板決定了木桶的容量。有的倉庫采用了很多的高科技產(chǎn)品，各種設施設備也非常，但是由于各子系統(tǒng)間協(xié)調(diào)性、兼容性不好，造成整體運作能力比預期差很多。

提高空間利用率
早期立體倉庫的構(gòu)想，其基本出發(fā)點就是提高空間利用率，充分節(jié)約有限且寶貴的土地。在西方有些發(fā)達國家，提高空間利用率的觀點已有更廣泛深刻的含義，節(jié)約土地，已與節(jié)約能源、環(huán)境保護等更多的方面聯(lián)系起來。有些甚至把空間的利用率作為系統(tǒng)合理性和性考核的重要指標來對待。
立體庫的空間利用率與其規(guī)劃緊密相連。一般來說，自動化高架倉庫其空間利用率為普通平庫的2-5倍。這是相當可觀的。

隨著經(jīng)濟全球化步伐的加快，物流供應鏈中蘊藏的潛力越來越引起人們的注意。而物流中心則是物流供應鏈中重要的樞紐之一。它是接受并處理下游用戶的訂貨信息，對上游供應方的大批量貨物進行集中儲存、加工等作業(yè)，并向下游進行批量轉(zhuǎn)運的設施和機構(gòu)。而實現(xiàn)這些功能的直接執(zhí)行機構(gòu)包括：
（1） 自動倉儲設備（自動化立體倉庫）
（2） 其它貨架（平面托盤貨架與流動貨架等）
（3） 各種輸送機（輥道輸送機、鏈條輸送機、皮帶輸送機、升降移載機、提升機等）
（4） 各種分揀設備
（5） 無人臺車（AGV、RGV、LGV）
（6） 其它各種輔助設備

自動化立體倉庫可以形成的生產(chǎn)鏈，促進了生產(chǎn)力的進步。人士指出，由于自動化立體倉庫的存取，因此可以有效地連接倉庫外地生產(chǎn)環(huán)節(jié)，可以在存儲中形成自動化的物流系統(tǒng)，從而形成有計劃有編排的生產(chǎn)鏈，使生產(chǎn)能力得到了大幅度的提升。
板材立體倉庫的優(yōu)點包括提高空間利用率、降低勞動強度、提高管理效率等。這種倉庫能夠?qū)⒃痉稚?、混亂的板材存儲變得有序、，同時能夠降低人力成本，提高生產(chǎn)效率。