由于蚯蚓糞中含有高達(dá)45%以上有機(jī)物和無機(jī)營養(yǎng)物以及植物生長激素，與其他肥料相比，具有衛(wèi)生、無異味、顆粒細(xì)小均勻，吸水保水、透氣等性能還富含有益微生物，這些都是其他合成肥料所不具備的，因此可作為園林花卉、溫室大棚種植的有機(jī)肥。 它所含的吲哚乙酸、赤霉素等激素能促進(jìn)植物生長；所含黃腐酸對植物（如花椒、番茄）生長量、葉面積等亦有明顯促進(jìn)作用。


蚯蚓糞中還富含各種微生物，微生物不僅可以使復(fù)雜的物質(zhì)礦化為易于植物吸收的有效營養(yǎng)成分，還能合成一系列有生物活性的物質(zhì)，如糖、氨基酸、維生素等，這是蚯蚓糞所特有的性質(zhì)。正是因?yàn)轵球炯S含有大量的營養(yǎng)物質(zhì)，和微生物菌群，對植物生長有著神奇的效果，才被譽(yù)為“有機(jī)肥”。


蚯蚓糞顆粒小，具有多孔性，比表面積龐大，吸附能力強(qiáng)，可以較大程度地吸附土壤中的重金屬； 蚯蚓糞中的腐殖酸也是一種很強(qiáng)的吸附劑，能吸附可溶態(tài)重金屬而降低其生物有效性；蚯蚓糞中的大量微生物群本身就能與土壤中各種有機(jī)和無機(jī)膠體相互作用而對重金屬進(jìn)行吸附、富集、沉淀等，從而降低重金屬的可利用性。由此可見，蚯蚓糞在修復(fù)土壤、鈍化土壤中有害重金屬方面也起到重要作用。