然而，對于原始生產(chǎn)者來說，要實現(xiàn)碳減排的氣候目標(biāo)還遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠。根據(jù)國際能源機構(gòu)的報告，為了實現(xiàn)可持續(xù)發(fā)展目標(biāo)，到2030年，運輸生物燃料的生產(chǎn)需要確保每年增長10%。2019年的增長率僅為6%，國際能源署預(yù)測，未來五年的平均產(chǎn)出增長率僅為3%。

生物燃料的發(fā)展瓶頸盡管生物燃料已在世界各個領(lǐng)域得到應(yīng)用，但目前還沒有成為國際能源的主力軍。主要原因是以下限制。原材料來源不穩(wěn)定。由于多種原因，廚房廢油和木本油料作物作為原料來源不穩(wěn)定。

產(chǎn)品成本高。以生物航空燃料為例，其成本是石油航空煤油的數(shù)倍，在成本上沒有競爭優(yōu)勢。雖然航空公司也會購買一定數(shù)量的生物航空燃料，但考慮到成本，購買量不會很大。此外，成品油的生產(chǎn)還將產(chǎn)生外部間接成本。

即所有轉(zhuǎn)化過程將不可避免地導(dǎo)致新的污染源，包括二氧化碳和其他污染物的排放；如果煉油后的廢渣，特別是煉油廢油的廢渣處理不當(dāng)，也會造成污染，治理污染的成本終會增加到成品油的價格中。

2012年航空公司的累計碳排放量不得超過基線的97%，2013年不得超過基線的95%。在排放制度實施初期，航空公司可以免費獲得一定比例的免費排放配額，但免費配額逐年減少，非免費配額需要通過有償拍賣獲得。

20世紀(jì)70年代，美國能源部為了發(fā)展可持續(xù)能源，對微藻進(jìn)行了大規(guī)模的收集、篩選和鑒定，終獲得了300多種產(chǎn)油微藻，即脂類占細(xì)胞干重20%以上的微藻。其中，小球藻微球菌的脂比高達(dá)68%。據(jù)估計，藻類的年產(chǎn)油量可達(dá)到每公頃養(yǎng)殖面積15000至80000升。