藍莓苗的根系沒有根毛。正因如此，藍莓根系的吸收能力比具有根毛的根系小得多。其吸收面積只有同樣大小具有根毛的小麥根系的1/10。藍莓的根系細，呈纖維狀，細根在分枝前直徑為50～75um。
值得注意的是，幾乎所有藍莓的細根都有內(nèi)生菌根的寄生，從而克服藍莓根系由于沒 有根毛造成的對水分及養(yǎng)分的吸收困難。近年來，眾多的研究已，菌根的寄生對藍莓生長是有益的。
矮叢藍莓根系的主要部分是根狀莖。據(jù)估計，矮叢藍莓大約85%的莖組織為根狀莖。不定芽在根狀莖上萌發(fā)，并形成枝條。根狀莖一般為單軸形式，直徑3～6。根狀莖分枝頻繁，在地表下6～25深的土層內(nèi)形成緊密(穿插)的網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)。新發(fā)生的根狀莖一般為粉紅色，而老根狀莖為暗棕色并且木栓化。矮叢藍莓的根系分布在上層中的有機質(zhì)層。

藍莓苗新梢生長莖粗的增加和長度的增加呈正相關(guān)。按照莖粗，新梢可分為三類：細 5。莖粗的增加與新梢節(jié)數(shù)和品種有關(guān)。對晚藍品種調(diào)查發(fā)現(xiàn)，株叢中70%新梢為細梢、25%為中梢，只有5%為粗梢。若形成花芽，細梢節(jié)位數(shù)至少為11 個、中梢節(jié)位數(shù)為17個、粗梢節(jié)位數(shù)為30個。藍莓新梢在生長季內(nèi)多次生長，2次生長普遍。葉芽萌發(fā)抽生新梢，新梢生長到一定長度 停止生長，生長點小葉變黑形成黑尖，黑尖期維持2周后脫落并留下痕跡，叫黑點。2～5周后葉芽重新萌發(fā)，發(fā)生轉(zhuǎn)軸生長，這種轉(zhuǎn)軸生長1年可發(fā)生幾次。后1次轉(zhuǎn)軸生長形成花芽，開花結(jié)果后枯死，下部葉芽萌發(fā)新梢并形成花芽。

藍莓苗的根系適宜疏松、有機質(zhì)含量高的酸性基質(zhì)，一般pH值4.0～5.2為宜。不同的品種、苗齡、生育期對基質(zhì)要求差異較大。小苗期對基質(zhì)要求嚴格，隨著苗齡的增長，對基質(zhì)的要求可適當放寬。