目前，國(guó)內(nèi)現(xiàn)有的一些畜禽糞便發(fā)酵技術(shù)普遍存在著發(fā)酵，遠(yuǎn)距離運(yùn)輸，集中處理高成本的問題。同時(shí)因?yàn)榘l(fā)酵工藝落后，占地面積大，發(fā)酵過程中因發(fā)酵工藝落后造成地下水的污染和因發(fā)酵不全產(chǎn)生的氣味，使蚊蠅滋生對(duì)周圍環(huán)境產(chǎn)生嚴(yán)重影響。同時(shí)發(fā)酵生產(chǎn)受氣候影響嚴(yán)重，雨雪天無(wú)常工作，冬季因低溫導(dǎo)致設(shè)備無(wú)法處理糞便的現(xiàn)象。發(fā)酵時(shí)間普遍長(zhǎng)達(dá)1-2個(gè)月，耗費(fèi)工作人員數(shù)量多。

生物菌肥的應(yīng)用范圍廣泛，可以用于農(nóng)田、果園、花卉、蔬菜等各類植物的生產(chǎn)中。它能夠改善土壤質(zhì)量，提高作物產(chǎn)量和品質(zhì)，降低化肥使用量，減少農(nóng)業(yè)對(duì)環(huán)境的負(fù)面影響。同時(shí)，生物菌肥還可以用于土壤修復(fù)和廢棄物處理等領(lǐng)域，具有很高的應(yīng)用前景和市場(chǎng)潛力。

微生物代謝物有直接殺菌的作用且進(jìn)入土壤會(huì)在根際定殖，搶占生態(tài)位點(diǎn)讓線蟲及真無(wú)法侵染。有益微生物進(jìn)入土壤會(huì)在根系周圍產(chǎn)生大量粘多糖與植物分泌的粘液及礦物膠體、有機(jī)交替相結(jié)合，形成土壤團(tuán)粒結(jié)構(gòu)，提高土壤蓄肥、保水能。